在羊肚菌种植中，一个非常大的问题就是菌种不稳定。赵琪说：“同一个菌株，在云南种植得非常好，但四川、重庆却没有产出，甚至同一亩地，相邻不到10米，也有产出不一致的情况出现。”除此之外，菌种退化现象明显、菌种制作龙头企业数量少，标准化田间栽培、管理方法缺少，都是制约羊肚菌产业化发展的瓶颈。 赵琪意识到管理的重要性是因为自己曾在“栽了跟头”。他说：“大概15年前，我认为种植羊肚菌非常简单，只要雨水充足、湿度够就行。头一年羊肚菌长势喜人，但到了第二年产量就下滑了。”经过这次他意识到，羊肚菌种植绝不是“懒庄稼”，而是需要因地、因时制宜，给出不同的解决方案。 通过多年在外摸底，赵琪坦言，目前羊肚菌种植最多只有30%会盈利，剩下的基本是亏本或者持平。他说：“很多人说种羊肚菌靠运气，其实运气是有规律可循的，只要达到适宜的湿度、温度、土壤pH值，有一套标准化的管理种植技术，就基本可以实现盈利。” 围绕着“不出菇”和出菇后“成菇难”的问题，团队选育获得优异栽培菌株20余个，借助基因手段，突破了羊肚菌大田种植中因为种质差异而引起的产量不稳定的技术瓶颈，将成菇率提高20%~30%。 同时，团队还创新了羊肚菌标准化大田生产关键技术，研发出了一系列“标准化栽培模式”和“幼菇标准化管护技术”，打破了传统的“冬播春收”模式，洪晃的照片结合云南“十里不同天”的地理气候特点，提出了“春播夏收”“夏播秋收”和“秋播冬收”新模式，将种植周期由120~180天缩短至60~100天，实现了羊肚菌大田四季高效栽培。 在采访中，赵琪还算了一笔“经济账”。按照传统一季的方法，当前的羊肚菌平均亩产为80～150公斤，这样算下来，种一季每亩只有3000元利润。但如果再采用新技术，8月种植、11月至次年1月收菌，虽然亩产只有60～80公斤，但错开了出菌旺季，收购价可达300元/公斤，算下来每亩有8000余元利润。 他说：“尤其是云南和我国西部地区，30%～40%的地方可以一年种两季。截至目前，我们团队在云南、新疆等7省、区累计示范推广达1万余亩，单季每亩纯收入达8000余元，效益非常明显。”
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